La diversidad de plantas de Sonora refleja variados ecosistemas y tipos de vegetación: selva baja caducifolia, matorral espinoso de piedemonte y matorral espinoso costero, desierto sonorense, desierto chihuahuense, bosque madrense, pastizal desértico, y humedales como manglares y bosques de río. La flora del estado de Sonora, con un área de 184 mil 934 km², actualmente contiene 3,663 taxones específicos e intraespecíficos documentados con ejemplares de herbario.

La colección botánica más importante en Sonora se encuentra en el Herbario USON de la Universidad de Sonora, supera los 31 mil 700 ejemplares, de los cuales más de 23 mil 400 representan arriba de 3.5 mil taxa de Sonora. El Herbario USON está adscrito al Departamento de Investigaciones Científicas y Tecnológicas de la Universidad de Sonora (DICTUS) y, por sus líneas de investigación, se encuentra dentro de la Academia de Conservación y Aprovechamiento de la Diversidad Vegetal (ACADIVE).